古日格斯臺國家級自然保護區(qū)地處大興安嶺南部山地余脈的西麓，位于錫林郭勒盟西烏珠穆沁旗巴拉嘎爾高勒鎮(zhèn)東南部55公里處。自然保護區(qū)的南部與赤峰市的塞罕烏拉國家級自然保護區(qū)、烏拉壩---石鵬溝自治區(qū)級自然保護區(qū)相鄰，西、東北部分別于西烏旗其他鄉(xiāng)鎮(zhèn)為界。地理坐標為東經(jīng) 118度03分45秒—118度48分36秒，北緯44度18分21秒—44度34分52秒，保護區(qū)總面積為98931公頃，其中核心區(qū)面積43919公頃，占保護區(qū)總面積44.4%；緩沖區(qū)面積15883公頃，占保護區(qū)總面積16.1%；實驗區(qū)面積39129公頃，占保護區(qū)總面積39.5%。保護區(qū)內(nèi)有林地面積為60078.7公頃，占保護區(qū)總面積的60.7%；草原35091.8公頃，占保護區(qū)總面積的35.5%；濕地3760.5公頃，占保護區(qū)總面積的3.8%。

古日格斯臺國家級自然保護區(qū)是以該自然保護區(qū)內(nèi)的“古日格斯臺山”蒙語命名，漢譯為“有狍子的山”的意思，該山海拔為1957米，是錫林郭勒盟最高的山。古日格斯臺國家級自然保護區(qū)成立于1998年，2008年5月，被評為盟級環(huán)境教育基地，2012年1月，經(jīng)國務院辦公廳審定為國家級自然保護區(qū)，成為錫林郭勒盟境內(nèi)第一個森林生態(tài)系統(tǒng)類國家級自然保護區(qū)。自然保護區(qū)管理局現(xiàn)有管理人員25人。保護區(qū)管理處現(xiàn)設6個科室，分別為辦公室、保護科、科研監(jiān)測科、宣教科、計財科、社區(qū)服務中心。下設二個林業(yè)公安派出所，2個管理站，7個管護點，3座瞭望臺，有專職護林員70名。

古日格斯臺自然保護區(qū)是大興安嶺南部山地最典型、最完整森林、草原生態(tài)系統(tǒng)，處于東亞闊葉林與大興安嶺北部寒溫帶針葉林、草原與森林雙重交匯過渡的典型地帶，是連接各大植物系的紐帶和橋梁。自然保護區(qū)生物類型多樣，動植物物種豐富，被稱為“植物的王國，動物的樂園”。有森林、沙地-伏沙地復合群落、灌叢、草原、草甸、濕地6大植被類型，包括了10個植被亞型、47個群系組、80個群系。

經(jīng)實地考察，區(qū)內(nèi)有苔蘚植物22科75種，大型真菌植物16科52種，其中可食用真菌有蒙古口蘑、野蘑菇、金針磨、木耳、毛木耳等30余種，藥用真菌有大馬勃、小馬勃、紫馬勃、靈芝等10余種；維管植物94科330屬654種6變種，有野大豆、草蓯蓉、沙蘆草、內(nèi)蒙古大麥草等國家二級保護植物4種；有山丹、芍藥、龍膽、沙參等內(nèi)蒙古自治區(qū)重點保護植物20種；有甘草、秦艽、達烏里龍膽、防風、黃芩、遠志國家重點保護野生藥用植物6種；有豬毛菜、蕨菜、黃花菜、山蔥、龍須菜、野韭菜等野菜100余種。

由于古日格斯臺自然保護區(qū)特殊的地理位置和多樣豐富的自然資源，為野生動物提供了良好的隱蔽、覓食、棲息和繁殖條件，成為野生動物活動場和避難所，每到繁殖期，有大量的黑鸛、大鴇等珍稀瀕危鳥類來這里繁衍生息。經(jīng)調(diào)查確定，保護區(qū)內(nèi)現(xiàn)有脊椎動物66科223種，其中鳥類有165種，獸類有44種，爬行類有5種，兩棲類有3種，魚類6種。其中有國家一級保護動物黑鶴、大鴇、金雕、丹頂鶴4種，有國家二級重點保護動物黑琴雞、鴻雁、大天鵝、灰鶴、大雁、燕隼、青羊、馬鹿、雪兔、狼、草原雕、猞猁等29種，有《國家重點保護脊椎動物名錄》中記載的33種，被列為《中國瀕危動物紅皮書》的有21種，被列為《世界受脅鳥類》的有5種。

自然保護區(qū)有豐富的水資源，流徑7萬多平方公里烏珠穆沁盆地的9條河流，其中有5條主要河流發(fā)源于古日格斯臺自然保護區(qū)。屬烏拉蓋水系，河流總長度為1123公里，流域面積16396平方公里，年徑流量1.1億立方米。保護區(qū)不到1000平方公里的面積涵養(yǎng)著烏珠穆沁盆地70%的河流量，是烏? ??穆沁草原人民生產(chǎn)生活的生命線與經(jīng)濟線。

保護區(qū)加強各方面的管理工作，建立健全各項規(guī)章制度，全面實現(xiàn)了規(guī)范化管理。對保護區(qū)主要路口及重點保護區(qū)域制定了防火宣傳及愛護環(huán)境的宣傳標語；對保護區(qū)四至界限埋設界樁。保護區(qū)每年利用“3.12”植樹節(jié)、“4.22”地球日、“6.5”世界環(huán)境日等重大環(huán)境紀念節(jié)日，通過媒體、發(fā)放傳單等多種形式進行廣泛宣傳教育活動，以此提高人們的保護環(huán)境、愛護環(huán)境、建設環(huán)境的良好意識。所以，內(nèi)蒙古古日格斯臺自然保護區(qū)是集保護、科研、旅游為一體的綜合類保護區(qū)。、

主要保護對象：

1、保護大興安嶺南部山地北麓森林-草原生態(tài)系統(tǒng)及其所包容的物種多樣性。

2、保護烏珠穆沁盆地國際重要濕地烏拉蓋水系河源濕地生態(tài)系統(tǒng)。

3、保護棲息于該生態(tài)系統(tǒng)中的野生馬鹿（東北亞種）、斑羚、青羊、野豬、猞猁等大型野生動物種群。

4、保護國家重點保護鳥類大鴇、黑鸛、金雕、丹頂鶴、黑琴雞、紅腳隼、黃腳隼、蒙古百靈、兀鷲、蓑羽鶴及其珍稀瀕危鳥類的繁殖地。